En l'an 1620, le "Mayflower" quitte l'Angleterre pour le Nouveau Monde. A son bord, des calvinistes fuient leur pays et les persécutions dans l'espoir d'exercer leur culte, ailleurs et librement au sein d'une société nouvelle. Le capitaine Jones les considère comme une poignée de fanatiques, imbus de leur foi et exaltés par un projet sans avenir. Il est cependant séduit par l'une des passagères, Dorolhy, dont il ne comprend pourtant ni les croyances, ni l'admiration qu'elle voue à son mari, William Bradford, leader du groupe religieux.
Après plusieurs jours en mer, le capitaine du bateau escorteur, plus hostile encore que Jones à l'entreprise, saborde son navire. De retour forcé en Angleterre, les colons voient les semaines passer et les chances de reprendre la mer s'amenuiser d'autant que les réparations de l'escorteur n'avancent pas. William Bradford exige alors le départ immédiat du "Mayflower", tous les colons à son bord y compris ceux de l'escorteur. Pour le capitaine Jones, l'opération est suicidaire Il accepte néanmoins sans garantir leur survie.
Après quelques semaines de navigation paisible, le "Mayflower" essuie une tempête au cours de laquelle Jones sauve William Bradford de la noyade, et qui laisse les hommes exsangues et le navire endommagé. L'eau et les vivres viennent à manquer, pneumonie et scorbut se répandent à bord et les accrocs entre passagers et équipage se multiplient. Seule Dorothy se sent de plus en plus proche du capitaine.
Les jours passent et, alors que tout espoir semblait perdu, la terre est enfin en vue. Une première chaloupe d'hommes valides part en reconnaissance de la côte pour définir l'installation de ta colonie. Dorothy, toujours déchirée par ses sentiments, avoue son amour au capitaine. Mais c'en est trop pour elle. Une nuit, elle passe par-dessus bord et se noie.
Jones, qui devait abandonner la colonie une fois le nouveau continent atteint décide de rester en souvenir d'elle. Grâce à lui et au gîte qu'il offre sur le "Mayflower", les colons passent l'hiver et construisent les premières habitations. Responsable de leur survie et maintenant convaincu de leur projet, le capitaine Jones reprend la mer en promettant de revenir